光合成関連の単語

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昨日の講義で紹介した英語です。

ATP（adenoshin triphosphate） アデノシン三リン酸
ADP（adenosine diphosphate） アデノシン二リン酸
NADP（nicotinamide adenine dinucleotide phosphate） ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸
NADP＋ 酸化型NADP
NADPH 還元型NADP
chloroplast 葉緑体
chromoplast 有色体
leucoplast 白色体
amyloplast 澱粉体
thylakoid チラコイド
frequency 振動数
wavelength 波長
quantum 光量子
photosystem I 光化学系I
photosystem II 光化学系II
photochemical reaction 光化学反応
cytochrome b6/f シトクロムb６／f複合体
plastiquinone プラストキノン
ferredoxin フェレドキシン
ferredoxin NADP reductase フェレドキシンNADPレダクターゼ
reaction center 反応中心
antenna pigments アンテナ色素
pheophytin フェオフィチン
quinone キノン
tyrosine チロシン
iron-sulfur complex 鉄-硫黄複合体
ATP synthase ATP合成酵素
plastid 色素体
plastoglobule プラストブロビエール
lipid globule 脂質小粒
plastidial DNA 色素体DNA
Z-scheme Z機構
lumen ルーメン
stroma ストロマ
grana グラナ
ribosome リボソーム
lamella ラメラ
fluorescence 蛍光
diatom 珪藻
dinoflagellate 渦鞭毛藻
green algae 緑藻
brown algae 褐藻
red algae 紅藻
chlorophyll クロロフィル
carotenoid カロテノイド
phycobiliprotein フィコビリンタンパク質
oxygen evolving complex 酸素発生複合体

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RStudioとggplot()：プロットができないとき

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いま、RStudioを統計学の講義で使っています。ggplot2, plyr, とreshape2のパッケージも紹介して、多くの学生は上手に使えています。ところが、日本語入りの図をつくって、knitするとよく膨大な警告がでてきます。 それを解消するため、このコードをRmdファイルの一番目のコードブロックにいれてからknitさせています。 options(device = function(file, width = 7, height = 7, ...) {  cairo_pdf(tempfile(), width = width, height = height, ...)}) ところが、このコードを使うと、時々RStudioのプロットパネルに図が出てこないことがあります。dev.off()など使えば解消できることもあったが、しつこいケースもありました。 いろいろ調べたところ、このコードを通常に使っているときに実行し、プロットなどをしようとすると、問題が出てくることがわかった。 dev.list()をすると、RStudioGD やpng のデバイスが表示されない場合、RStudioGD()を実行すればもとおりになります！ ということで (コピーペ用)、 dev.list() # を実行します。ここで、RStudioGDの表示がなければ、つぎのコードを実行してください。 RStudioGD() #　これでもとどおりになるとおもいます。
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