藻場の物理的環境をしらべよう
3月10日、TさんとT田先生と一緒にけいてん丸にのって桜島の沿岸へ。何か所いった結果、藻類学の実習によくつかわれる浜にいった。ヒジキの藻場に流速計、蛍光度計と小型CTDを設置し、5~10分毎にトレーサを注入。船がとうるたびに、波がきたので結構おもしろいデータがとれたとおもう。藻場はいまから大きくなるので、今後の実験も鍛えできそう。早く，4月にならないかな。
RStudioとggplot()：プロットができないとき
いま、RStudioを統計学の講義で使っています。ggplot2, plyr, とreshape2のパッケージも紹介して、多くの学生は上手に使えています。ところが、日本語入りの図をつくって、knitするとよく膨大な警告がでてきます。 それを解消するため、このコードをRmdファイルの一番目のコードブロックにいれてからknitさせています。 options(device = function(file, width = 7, height = 7, ...) { cairo_pdf(tempfile(), width = width, height = height, ...)}) ところが、このコードを使うと、時々RStudioのプロットパネルに図が出てこないことがあります。dev.off()など使えば解消できることもあったが、しつこいケースもありました。 いろいろ調べたところ、このコードを通常に使っているときに実行し、プロットなどをしようとすると、問題が出てくることがわかった。 dev.list()をすると、RStudioGD やpng のデバイスが表示されない場合、RStudioGD()を実行すればもとおりになります！ ということで (コピーペ用)、 dev.list() # を実行します。ここで、RStudioGDの表示がなければ、つぎのコードを実行してください。 RStudioGD() # これでもとどおりになるとおもいます。
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